杨燕为省医学会临床药学分会第一届、第二届副主委、南通市药学会第八届、第九届常务理事、省药学会药学史专委员委员、南通大学硕士研究生导师。曾担任省药学会感染药学专委会委员、省药师协会临床药学分会委员。2010年作为课题负责人《特殊使用类抗菌药物临床用药调查及干预评估》获市级课题立项，在规定时间内完成结题和成果鉴定，并于2012年12月获南通市科技进步三等奖；2015年以第3完成人参与题为《抗肿瘤中成药合理用药的评估及干预》的局级课题；工作以来在中华级、国家级、省级刊物上发表学术论文三十余篇；并多次分别荣获市政府、市科协和通大附院自然科学优秀论文三等奖和优秀科技论文奖等；2016年5月作为硕士研究生导师指导本院2位在读硕士顺利通过同等学历研究生论文答辩，并获与会专家好评。